样本库

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生物样本作为转化医学研究的重要资源,正在日益受到各国高度的重视。在美洲有影响力的组织有1999年成立的国际生物和环境资源协会( ISBER )和2005年由美国 NCI 成立的生物存储库和生物标本研究实验室( OBBR )。纵观国内生物样本库发展现状,可谓各有千秋,琳琅满目。绝大多数储存方式以冰箱为主,样本库的规模大小也与冰箱的台数相关,衡量样本库的规模似乎也与样本的存储量或以冻藏设备数量为硬指标。在庞大的数量背后我们可否注意到了可利用样本量有多少,也就是高质量的样本有多少?


那么样本库存储的数量与质量哪个更重要?


目前国内样本库正处于高速发展阶段,各大单位对于建库就像军备竞赛式的规模化,样本存储量也多达10到几十万。生物资源的广泛性固然是生物样本库的基石,也是国内样本库发展的当前现状,我们应该为有如此之多的生物样本资源感到欣喜,这是我们生物样本库数量化的优势。那么拥有如此之大的优势,我们应该如何发挥其应用价值?如何让样本库活起来?


建设生物样本库的旨在于生物样本背后信息的开发与应用,为科研与临床提供可靠的依据与指导意义。如何存储才能发挥其应有的作用。我们纵观世界高水平样本库的储样模式,举澳大利亚为例,食道癌患者保存样本成系统化,该库是这样保存样本的:唾液、口腔拭子、血液、组织、分泌物等,病灶和其相关处都存留样本,保证生物信息的完备,研究起来不会只局限于一处而是融汇贯通,关联研究其本。这也给我们国内样本库有了指导性的方向,不拘一格,大而广,或小而精都是样本库发展的出路。所以储存的标本类型不只局限于是血液或者组织,应该来源于患者的不同类型相关标本。当我们拥有如此成休系的标本后,深度挖掘样本所提供的价值,是转化医学的关键,不要让自己的样本库成为死库,由此观之,样本本身就是研究的核心,其质量问题当然也是重中之重。


保存高质量的冻存样本是检测患者基因型、转录组型、蛋白质组型以及代谢功能的最理想样本,要想对组织核酸、蛋白质、代谢产物等进行准确的分子分折,提取这些物质的原始样本的保存条件就至关重要,因为如果样本存在降解、样本中存在其它杂质,或者存在酶类抑制剂都可以对检测结果造成干扰。因此,为了满足大规模的转录组学筛选研究,就必须有足够数量的、保存质量良好的生物样本随时待用,生物样本库中的样本要满足这些要求,严格的标准化质控相当重要。对一些特定类型样本储存的质控标准,比如,DNA和RNA样本,确保其完整性和纯度是最重要的。对RNA样品,其纯度要根据其在260nm和280nm处的吸光光度值来判定,其完整性要通过琼脂糖电泳或显微微阵列来检测观察其在28s和18s大小的两条核糖体带。此外要检测RNA的完整性,还要计算RNA完整性系数(RIN) ,而且,所提取的RNA在经过逆转录之后,通过RT-PCR方法要能扩增出完整的基因。DNA样品的完整性的检测方法跟RNA基本相同,不过,其完整性是通过观察琼脂糖电泳后存在的一条完整的不弥散降解的高分子量条带来检测,也可以通过PCR之后完整基因的扩增能力来进行验证。


在国内,样本DNA相关存储基本都可以很好做到,可rna ,ctdna,ctc 等样本却不尽人意,而这些样本更具有深度研究价值。成系统的保存样本 ,同一人份血液,我们如果可以做到保存其DNA , rna ctdna ctc等,对疾病的研究和后期的大数据分析评估治疗都有质的飞跃。百泰克结合自身研发优势。适时推出血液保存管、游离核酸保存管、循环肿瘤细胞保存管,以高质量优势为样本库建设添砖加瓦,样本库的存在才有其实际的意义,样本库才能活起來。血液rna保存十分困难,降解严重是保存血液rna难点。所以我们取样时就应该选择良好的保存管来解决问题。百泰克血液rna保存管针对血液样木rna易降解给出了解决方案。


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